使用PCR或二代测序(NGS)进行基因分型和其它DNA分析时,需要一定量的高质量基因组DNA作为起始材料。获得高质量DNA的最主要瓶颈是组织的裂解。纤维状或其它难以裂解的组织需要使用长时间和繁冗的裂解步骤,经常导致DNA的低产量和低质量。QIAamp Fast DNA Tissue Kit基于QIAGEN开发的领先技术,通过创新的裂解管显著提高了产量并同时缩短了获得结果的总时间,克服了实验过程面临的一系列挑战。
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Performance
QIAamp Fast DNA Tissue Kit采用一种新颖的机械、化学和酶促混合裂解方法。每个试剂盒均包含一种裂解管,裂解管内有一种特殊形状的不锈钢微珠,可以帮助裂解组织,相比于其它方法裂解更为彻底。首先,组织样本和试剂混合物加入到裂解管中,然后使用普通台式漩涡混合仪(带有适当适配器)或珠磨机如TissueLyser II或TissueLyser LT进行匀浆,并在同一裂解管内进行短暂裂解。然后使用成熟的QIAamp提取技术将对DNA进行分离纯化。上述预处理过程将总的DNA提取时间从几小时降低到仅需30分钟。
除了加速提取DNA外,机械破碎步骤和充分的裂解流程还提高了DNA的产量。我们使用QIAxpert及另外一种荧光检测方法对不同组织类型DNA产量的提高情况进行了评估。结果显示QIAamp Fast DNA Tissue Kit可以提取出比标准方法多达10倍的DNA。
大多数NGS应用都要求使用高分子量DNA(>10 kb)以便获得更大的测序片段并使用生物信息学工具进行更为精确的组装。一些裂解方法可能由于剪切力而打断DNA,从而影响下游分析。与其它易将DNA打断为较短片段的裂解方法不同,QIAamp Fast DNA Tissue Kit可以获得25至50kb长度的DNA,非常适合于PCR或NGS应用。
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Principle
PCR和NGS等分子技术可发现复杂实验样本中未知的细节。使用这些技术获得可靠结果的关键是得到足够量的高质量DNA。当实验样本是纤维状或硬质组织时,裂解尤其困难,这直接影响可获得的DNA产品量。为解决这一问题,我们的QIAamp Fast DNA Tissue Kit使用了一种新颖的机械、化学和酶促混合裂解方法,使DNA产量比标准方法提高了5至10倍。预处理步骤使得DNA提取的总时间从几小时降低到仅需30分钟,因此除了获得高质量的适用于PCR和NGS的DNA之外,您还大大节省了时间。
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Procedure
QIAamp Fast DNA Tissue Kit采用一种新颖的机械、化学和酶促混合裂解方法对样本进行匀浆。Tissue Disruption Tube包含一种特殊形状的微珠,这种微珠经震荡后可有效裂解组织样本。仅需5分钟台式漩涡仪震荡或30秒高能珠磨机震荡即可充分匀浆组织。经优化的试剂在匀浆组织的同时可以使从被裂解组织释放出来的DNA保持稳定。消化混合液同时还含有蛋白酶K,可以在之后的短暂孵育中完全将样本裂解,并且不受机械匀浆的影响。另外,QIAamp Fast DNA Tissue Kit还可以适用于QIAcube,实现自动化样本制备。
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Applications
QIAamp Fast DNA Tissue Kit可从任意组织类型获得适于PCR和NGS下游应用的高产量、高纯度DNA。