Allprep FFPE DNA/ RNA Kit (50)

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  • 10950
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  • 10950

  • 品牌:Qiagen/凯杰
  • 货号:80234
  • 规格:1kit
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  • 辽宁省

    吉林省

    黑龙江省

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看了又看换一换

商品名称:Allprep FFPE DNA/ RNA Kit (50)

  • 货号:80234
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Features

  • 使用小样本量即可获得大量纯化产物
  • 在纯化同时,保持DNA和RNA的完整性
  • 高效分离RNA和DNA
  • 对同一FFPE样本进行全面的DNA和RNA分析
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Product Details

如要对基因组学和转录组学数据进行可靠比较,则需从同一样本中纯化DNA和RNA。AllPrep DNA/RNA FFPE Kit使用先进的溶解方法,从福尔马林固定、石蜡包埋的组织样本中纯化DNA和RNA。纯化产物适用于real-time PCR和焦磷酸测序等应用。

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Performance

使用AllPrep DNA/RNA FFPE Kit纯化的DNA和RNA的质量与使用QIAamp FFPE Tissue Kit和RNeasy FFPE Kit/miRNeasy FFPE Kit纯化的产物的质量相当(参见" Purification of DNA and RNA from FFPE samples")。因此,纯化产物可用于焦磷酸测序、real-time PCR和RT-PCR等下游应用(参见" Reliable amplification of DNA and RNA from FFPE samples"和" Array analysis following preamplification of cDNA targets")。
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Principle

AllPrep DNA/RNA FFPE Kit专为从FFPE样本中同时纯化基因组DNA和总RNA而设计。该试剂盒可使用同一样本纯化DNA和RNA,而非像其他纯化方法那样,需将样本分为两份再分别进行纯化操作。如将样本分为两份分别纯化DNA和RNA,其纯化出的DNA和RNA来自不同的细胞群落,可能具有不同性质特征。从同一样本中同时纯化DNA和RNA可减少浪费,因为FFPE样本是十分珍贵的样本,通常很难恢复且样本量少。

由于固定和包埋,FFPE样本中的核酸通常都严重片段化,核酸的分子量通常小于从新鲜或冷冻样本中分离出的核酸的分子量。从同一FFPE样本中分离DNA和RNA面临着很大困难:片段化的DNA长度短,且部分是单链结构;因此其更像RNA,而非完整的DNA。片段化DNA这一特性使得用物理方法分离DNA和RNA十分困难。AllPrep DNA/RNA FFPE Kit使用先进的溶解方法,从同一个FFPE样本中分别释放DNA和RNA。

尽管标准的质量控制分析(如凝胶电泳或芯片分析方法)无法检测到甲醛的化学修饰,但其对酶分析有严重干扰。AllPrep DNA/RNA FFPE Kit已经过优化,可最大程度上逆转甲醛化学修饰,而不引起DNA和RNA的进一步降解。

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Procedure

简单的流程可从同一个样本中纯化高品质DNA和RNA(参见" AllPrep DNA/RNA FFPE procedure")。AllPrep DNA/RNA FFPE Kit使用先进的溶解方法,从同一个FFPE样本中分别释放DNA和RNA。使用这种方法时,FFPE样本要在优化的裂解缓冲液中孵育,使得RNA释放出来,而DNA形成沉淀。离心后,将含有RNA的上清和含有DNA的沉淀分别处理,纯化RNA和DNA。再次进行孵育有一定的解交联作用,然后使用RNeasy MinElute或QIAamp MinElute离心柱纯化RNA和DNA。用柱上DNA酶处理纯化的RNA,以有效去除DNA污染。根据RNA与离心柱的结合情况,纯化的RNA中可能含有也可能不含miRNA等小RNAs。对于纯化后的DNA,可选择性进行柱上RNA酶消化,因为在离心前的DNA和RNA分离步骤中RNA污染水平已达到最低。
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Applications

尽管AllPrep DNA/RNA FFPE Kit已经过优化,可最大程度上逆转福尔马林化学修饰,而不引起DNA和RNA的进一步降解;但从FFPE样本中纯化获得的核酸不应该用于需要大分子量DNA或完整长度RNA的下游应用。一些应用可能需要进行化学修饰后,再使用片段化核酸(如:设计PCR和RT-PCR的小扩增子)。在cDNA合成中,应使用基因特异性引物,而非oligo-dT引物。如果无法使用基因特异性引物,则可使用任意引物。

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