高分子量DNA的高效分离
MagAttract HMW DNA Kit可确保基因组DNA >150 kb的可重复分离。采用脉冲场凝胶电泳比较MagAttract HMW DNA Kit及其他基于磁珠的步骤分离的DNA。MagAttract HMW DNA Kit在高分子量DNA分离方面具有出众的性能(参见
低分子量DNA的成功分离)。
稳定的高产量和纯度
MagAttract HMW DNA Kit采用了便捷简单的步骤,可获得高产量和纯度的高分子量DNA。温和的裂解条件最大程度地减少了DNA片段化现象,同时有效去除了污染物和PCR抑制剂,可以获得纯的高分子量DNA。相比其他供应商提供的经典的离心柱或磁珠分离方法,优化的MagAttract HMW DNA Kit试剂和步骤大幅提升了DNA的产量和纯度(参见
最高产量和纯度和
从各种样本类型获得更高的产量)。
有效去除PCR抑制剂
诸如real-time PCR或NGS等高敏感性的应用要求将抗凝剂、酶、二价阳离子及其他抑制剂全部去除。采用MagAttract HMW DNA Kit从分别经EDTA、肝素和枸橼酸盐稳定的血液样本中分离出DNA,进行real-time PCR扩增。所有样本均未观察到抑制现象,其C
T值与样本体积之间存在高线性相关关系(参见
含抗凝血剂的样本中无抑制现象)。
可直接用于新一代测序的基因组DNA
大规模平行测序(MPS)技术采用的是较短的读取长度,因此可以使用完整基因组DNA >10 kb进行测序。但采用标准DNA纯化产物仍然难以实现从头基因组组装并发现遗传性和获得性的结构变异。插入片段较大的双端测序文库对测序成功的影响很大,尤其是包含大量复杂重复序列的基因组。采用MagAttract HMW DNA Kit获取的高分子量基因组DNA可直接用于NGS实验(参见下表)。
总(长)映射读数 | 6521106 |
错误率 | 0.36% |
插入缺失率 | 0.01% |
嵌合体 | 0.14% |
重复百分比 | 1.15% |